大佬,您有空的时候可以给看下这是为什么嘛。C145_cds是一个monocle2对象。我看你的教程里面:
visCluster(object = df,plot.type = "heatmap",
markGenes = gene)里面的df是你画图得到的,不知道为啥我这个就弄不了。你的这个可以标记基因的我太想用了
下面是我的代码和报错:
p<-plot_pseudotime_heatmap2(C145_cds[g.gene,],
-
-
,hmcols = viridis(256),cores = 8,
-
show_rownames = F,return_heatmap = T)
visCluster(object = p,plot.type = "heatmap",
-
markGenes = c('GeneA', 'GeneB'),
-
pseudotime_col = c("green","red"))
Error in if (object$type %in% c("scRNAdata", "monocle", "wgcna")) { :
argument is of length zero
大佬,您有空的时候可以给看下这是为什么嘛。C145_cds是一个monocle2对象。我看你的教程里面:
visCluster(object = df,plot.type = "heatmap",
markGenes = gene)里面的df是你画图得到的,不知道为啥我这个就弄不了。你的这个可以标记基因的我太想用了
下面是我的代码和报错:
Error in if (object$type %in% c("scRNAdata", "monocle", "wgcna")) { :
argument is of length zero